拔牙時牙根斷裂，多數情況下牙根可以取出，但也有少數情況無法取出或取出風險過大，危害應根據具體情況而定。
如果牙根離上頜竇較近，可能輕輕觸碰牙根後使其掉入上頜竇中，可能需進行全麻手術將斷根取出。
如果牙根離下頜神經管較近，反覆觸碰牙根可能會損傷下頜神經，造成嘴唇麻等症狀。這時如果牙根較短，為2-3mm，可以讓牙根自行吸收或排出，通常不會引起嚴重問題。如果牙根較長，如有2/3的牙根斷在裡面，則需將牙根取出，如多磨骨頭、用特殊器械等。若在局麻下部分牙根無法取出，可以先觀察，如果有發炎症狀，及時服用消炎藥治療。但如果沒有發炎，可讓其長在骨頭中並注意觀察，當牙根逐漸排出時再拔掉牙根。
牙根斷了，首先要觀察牙根折斷的深度、大小以及範圍，並且要進行相應的輔助檢查，例如可以進行牙片的檢查及根尖片的檢查，甚至是全口曲面體層片的檢查。通過這些檢查進行綜合分析，準確估測以評估牙根折斷的程度、大小。
如果牙根折斷不大，僅僅只是位於齦上，充分的可以決定進行牙根的保留。但是之前一定要與病人進行相應完善的醫患溝通，囑病人儘量保存牙根。
只要根中、根下以及根尖沒有折斷，可以考慮是否能進行完善的根管治療術以後，再進行樁冠的修復，最後再進行全冠的修復，從而就可以利用牙根。
但如果牙根折斷較為嚴重，已經到齦下很深的部位，並且有可能有根中1/3，以及根尖1/3的折斷，可能還是得考慮將牙根拔出以後再進行植牙的修復，以及其他相應的修復。
在臨床上拔牙斷根是比較常見的現象，通常拔牙斷根後可以把拔除斷根，但特殊情況下，拔除斷根的風險較大，比如斷根離上頜竇較近，或下頜離下牙槽神經管較近，若花費較大精力拔除斷根，可能導致牙根進入上頜竇或下頜神經管，壓迫神經，導致嘴唇麻木等。
此時需要評估是否有必要冒險，如果剩的牙根較短如2-3mm，甚至更短，風險較大時，可以簡單嘗試，如果嘗試後未成功，可以先觀察。牙根較短，多數可能會逐漸自行吸收，也可能自行排出，如果未出現症狀，可以先觀察，如果存在症狀考慮處理。
如果根斷較長比如5-6mm，考慮取出斷根，比如通過去骨手術等拔除斷根。如果牙根未取出，可以暫時觀察，如果存在感染及時處理，很多時候牙根可能會逐漸排出。總之，不要有壓力，如果不放心可以定期複查。