晨起腰痛原因非常複雜，最常見的一般是慢性的腰背肌筋膜炎。在人休息狀態的時候由於局部炎症因子的滲出，經過晚上的休息，炎症因子沒有得到充分的吸收，這個時候早上起床的時候可能會表現出腰部的疼痛感。
主要的特點是早上起床的時候會感覺到明顯的疼痛，適當的活動10分鐘左右，腰部的疼痛感又慢慢的緩解。當腰部長期保持一個姿勢的時候，會疼痛比較明顯，活動以後這種疼痛會逐漸的減輕，這是最常見的早上起床的時候腰痛的原因。當然選擇的寢具也就是床墊，如果硬度不合適，當晚上睡覺的時候休息的時候，脊柱並沒有得到有效的休息，這個時候也可以引起明顯的腰痛。對於這種情況只要更換合適硬度的床墊，就可以達到有效的預防的目的。
早上起來之後腰痛，但是腿不麻，表現在起床想彎腰如刷牙洗臉時想往前哈腰，覺得腰像折了一樣，得拿手撐一下才舒服。其實最常見的是腰肌勞損，表現在是腰上，早上起來可能會不舒服。
對於腰肌勞損產生的原因無外乎是長期姿勢不良，還有過度負重，如經常有人搬重物、做力量鍛煉，甚至擼鐵、跑步太頻繁、太劇烈會引起肌肉勞損，往往肌肉勞損是兩個極端，要麼不動要麼動作過度，這是早上起來產生腰痛最常見的原因。但如果有的人出現了腿麻或其他地方竄著疼痛，再結合早上起來腰痛，要警惕有沒有椎間盤突出，還有其他神經疼痛的原因。
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每天睡醒了腰痛最常見的是肌肉疲勞，急性期可以稱為肌肉緊張筋膜炎，慢性期稱為腰肌勞損。這種情況和不良姿勢，白天工作過久或勞累、受涼等有關係。
比如長期的開車，彎腰負重或者長期做文案工作，活動較少，腰椎被拉伸，炎症物質滲出，所以造成肌肉酸痛。睡覺的時候要睡硬板床，太軟的床比如彈簧床不能很好休息腰背部肌肉，容易引起疼痛。其他原因包括內科疾病、胃腸道疾病引起的腰痛，泌尿系疾病以及女性的經痛或婦科炎症，老人的骨質疏鬆、骨質增生以及關節炎等，這些情況都會在睡醒了後引起腰部活動不靈以及疼痛，需要去正規醫院檢查清楚，然後對症治療。