發芽的洋蔥能不能吃，關鍵要看是否發生了霉變。如果沒有發生霉變，可以適當吃一些，因為此時沒有產生有害物質，不會對身體產生負面影響。只是其辛辣溫補的作用會下降，對於陽氣不足導致的手腳冰冷、面色蒼白、精神倦怠、容易疲倦，不能更好地溫補陽氣。
從西醫營養學的角度，發芽的洋蔥中含有的營養素種類會降低，數量會減少，營養素的比例也會發生變化，營養價值就會下降，但是沒有發生霉變，就沒有有害物質，所以此時可以吃。
但是發芽的洋蔥也發生了霉變，就不能再吃。洋蔥發芽的重要環境條件就是溫暖和潮濕，此時也容易發生霉變反應，所以當發現洋蔥發芽，也發生了霉變，就不要再吃，否則致病微生物進入到體內會影響身體健康。
已發芽而未腐爛的洋蔥雖然可以食用的，但其營養價值並不高。
洋蔥為百合科多年生草本植物，是一種常見的蔬菜。洋蔥含有蔬菜中極為少見的的攝護腺素A，它不僅能擴張血管、降低血液濃度，並增加冠狀動脈的血流量，預防血栓的形成，而且還能促進鈉鹽的排泄，達到降壓、降血糖的作用，對於高血脂、高血壓、糖尿病等均有一定的食療效果。此外，洋蔥中含有的大蒜素等含硫化合物和硒等抗氧化等物質，有殺菌、抗癌等效果，可增強人體免疫力。
通常來說，食用時應選擇無損傷、無蟲蛀、外部光滑、頸部較小、手捏感覺較為堅實的洋蔥，而對於已經發芽的洋蔥一般是不建議食用的。因為洋蔥發芽後，其養分會很快被消耗，品質也會下降，食用價值也會隨之大大降低。而且，發芽的洋蔥中間往往已經腐爛，而腐爛的洋蔥是不能食用的。
洋蔥發芽了還能吃，並不會對人體產生危害，也不會導致口味改變，只是會流失部分營養成分。因此，平時發芽的洋蔥不用扔掉，仍然可以在煮製之後食用。
洋蔥屬於常見的蔬菜，含有豐富的維他命、胺基酸，以及微量營養素等營養成分，適量進食可以為人體提供營養物質，滿足身體所需能量。如果洋蔥有發芽的情況，可以繼續食用，發芽後並不會產生龍葵鹼、黃麴黴素這些有毒物質，與馬鈴薯、花生的發芽情況不一樣。
通常發了芽的、或者長出青苗的洋蔥，如果沒有腐壞、發霉等情況，都可以吃，並不會產生對人體有害的物質。但洋蔥部分營養會在發芽過程中轉移到芽上，幫助其生長，所以會有部分營養成分流失。
如果家裡有洋蔥或其他食物，建議放置在陰涼乾燥處，保持良好的通風環境，減少洋蔥發芽或腐壞的情況。