對於慢性鼻竇炎的抗生素治療通常要控制在2週之內。慢性鼻竇炎是非常常見的疾病，病人會出現鼻堵、流膿鼻涕，甚至是頭痛和嗅覺下降等症狀。慢性鼻竇炎的藥物治療，包括鼻用的糖皮質類固醇、口服的抗生素和黏液促排劑等治療。
由於慢性鼻竇炎的發病機制比較複雜，尤其是抗生素的治療本身並不是慢性鼻竇炎治療的最重要的環節，很多慢性鼻竇炎，除了感染性的因素之外，更重要的是免疫性因素。因此，只有當慢性鼻竇炎的急性發作，或者是出現了急性的感染的時候，才會給病人使用抗生素。而且抗生素的使用，通常在1-2週。
還有一些病人可以採用口服小劑量的、長期的大環內酯類的抗生素去治療，大環內酯類的抗生素所起的作用是免疫調節劑的作用，而不是消滅細菌的抗生素的作用。要區分這兩種不同應用方式，一般的慢性鼻竇炎在急性感染期所使用的抗生素，不宜超過2週。
慢性鼻竇炎須查明原因，過敏引起者一般不需要使用抗生素，有些情況下可以服用大環內酯類抗生素，用藥療程不得少於12週。
慢性鼻竇炎診療指南指明，常規治療效果不佳、血清總IgE水平不高、沒有嗜酸性白血球增多以及變應原檢測為陰性的不伴鼻息肉的慢性鼻竇炎，臨床推薦小劑量使用大環內酯類抗生素，服藥需超過12週。
鼻黏膜炎症比較明顯的慢性鼻竇炎病人，如鼻黏膜分泌物比較多、充血腫脹比較明顯，可以常規劑量使用大環內酯類抗生素治療一週，等到病情緩解後再小劑量長期服藥，用藥療程為3~6個月。
另外慢性鼻竇炎在發生鼻竇急性感染時可以考慮使用抗生素，但用藥時長不能超過两週。慢性鼻竇炎病人絕對不能自行濫用抗生素藥物，否則不僅對病情無益，甚至會給個人帶來不必要的損害。
慢性鼻竇炎發病時間需要2個月以上，發病的時間比較長，所以臨床用藥也需要更長的時間，一般需要應用口服抗生素，口服時間是10-15天左右，需要口服黏液促排劑，可能需要1個月左右的時間。
另外需要應用鼻噴激素以及抗組織胺的鼻噴霧，療程可能需要1-2個月的時間，建議每天2次鼻腔沖洗，堅持1個月左右的時間，有部分慢性鼻竇炎病人通過藥物治療是沒有效果的，這樣的情況可以考慮手術。