慢性鼻竇炎須查明原因，過敏引起者一般不需要使用抗生素。有些情況下可以服用大環內酯類抗生素，用藥療程不得少於12週。
慢性鼻竇炎診療指引明示，常規治療效果不佳、血清總免疫球蛋白E（IgE）濃度不高、沒有嗜酸性白血球增多以及過敏原檢測為陰性且不伴鼻息肉的慢性鼻竇炎，臨床建議小劑量使用大環內酯類抗生素，服藥需超過12週。
鼻黏膜發炎比較明顯的慢性鼻竇炎患者，如鼻黏膜分泌物比較多、充血腫脹比較明顯，可以常規劑量使用大環內酯類抗生素治療一週，等到病情緩解後再小劑量長期服藥，用藥療程為3-6個月。
另外，慢性鼻竇炎在發生鼻竇急性感染時可以考慮使用抗生素，但用藥時長不能超過2週。慢性鼻竇炎患者絕對不能自行濫用抗生素藥物，否則不僅對病情無益，甚至會給個人帶來不必要的損害。
對於慢性鼻竇炎的抗生素治療通常要控制在2週之內。慢性鼻竇炎是非常常見的疾病，病患會出現鼻塞、流膿鼻涕，甚至是頭痛和嗅覺減退等症狀。慢性鼻竇炎的藥物治療，包括鼻噴類固醇、口服抗生素和黏液促排劑等治療。
由於慢性鼻竇炎的發病機轉比較複雜，尤其是抗生素的治療本身並不是慢性鼻竇炎治療最重要的環節，很多慢性鼻竇炎，除了感染性因素之外，更重要的是免疫性因素。因此，只有當慢性鼻竇炎急性發作，或者是出現急性感染的時候，才會給病患使用抗生素。而且抗生素的使用，通常在1-2週。
還有些病患可以採用口服小劑量、長期的大環內酯類抗生素去治療。大環內酯類抗生素所起的作用是免疫調節劑的作用，而不是消滅細菌的抗生素作用。要區分這兩種不同應用方式，一般的慢性鼻竇炎在急性感染期所使用的抗生素，不宜超過2週。