導致免疫系統失調的常見原因如下：若情緒低落，免疫系統有可能會出問題。年輕女性容易得紅斑性狼瘡，年輕男性容易得僵直性脊椎炎，免疫系統失調與雌激素水平、泌乳激素等激素水平有密切關係。在陰冷、潮濕、暴曬等環境時，會誘發免疫功能發生失調，造成免疫系疾病復發。藥物性狼瘡，以及服用抗結核、苯環類、抗憂鬱、抗癲癇類藥，均會使免疫系統失調。內分泌失調、遺傳因素等，均會導致免疫系統失調。
免疫系統失調產生的症狀較多，可出現低熱、關節疼痛、口腔潰瘍、脫髮、上呼吸道感染，以及雷諾氏症、皮肌炎、硬皮症等自身免疫病表現，當出現症狀應及時到醫院就診。
免疫系統失調包括免疫功能過強或免疫功能過弱，免疫功能是指免疫防禦功能以及免疫調節機制等。當免疫調節機制過強以及免疫功能過強時，可對自身抗原產生自身抗體，從而產生自身免疫病，對外來抗原有耐受性的異常，出現過敏反應。
當免疫功能過弱，對於外來細菌的抗體侵染、病毒感染等，不能夠產生相應抗體，則產生免疫缺陷性疾病。如原發性免疫缺陷疾病，包括T細胞功能缺陷、細胞免疫功能缺陷，繼發性疾病如獲得性免疫缺陷症候群即愛滋病。
輕度的免疫系統失調經過調理可以恢復。臨床表現比較複雜，免疫系統功能失調比較嚴重的病人，如果恢復到正常比較困難。大部分自身免疫性疾病不能夠完全恢復到正常，也不能完全根治。免疫功能缺陷及免疫調節異常的病人，應該及時到醫院就診，做相關檢查，明確是細胞免疫系統失調、體液免疫系統失調，還是白血球的吞噬功能異常。
如果出現免疫系統功能失調症狀，一定要到醫院請專科醫生進行診治。及時用免疫球蛋白以及增加細胞免疫功能、體液免疫功能的藥物進行治療，使病情得到控制，免疫功能得到較好得恢復，但關鍵還是要早發現、早治療。