思覺失調症沒有單一的病因，目前看來是多致病因素，像很多其他疾病一樣，是遺傳與環境因素的聯合效果。在遺傳上，如果沒有思覺失調症家族史，患病的風險小於1%，反過來如果父母之一患病，患思覺失調症的風險就上升到13%，父母雙方患病，風險就接近50%了。大腦中的多巴胺和血清素的失衡和患思覺失調症相關。
出現症狀之前，病人通常會變得脾氣很壞、焦慮等，以前通常歸罪於犯病了，現在看來不無可能是這些壓力的因素引發了思覺失調症。
一直懷疑思覺失調症是娘胎裡帶來的，比如受過傷或者有過病毒感染，還發現懷孕時吸菸會增加胎兒患思覺失調症的風險，但一直沒有足夠的證據。就是最近，研究比較了思覺失調症病人和正常人的幹細胞，發現了與思覺失調症相關的基因缺陷，進一步把思覺失調症的起源指向娘胎，因此很可能是一種先天性疾病。毒品和酒精會增加患思覺失調症的風險。
思覺失調症通常是由生活環境因素、個體心理的遺傳易感素質、刺激事件等綜合因素引發。如有家族思覺失調症遺傳易感基因，通常後天遇到一些環境刺激、壓力過大等會引起思覺失調症的發作。雖然思覺失調症目前的病因並不完全明確，但是治療效果是比較顯著的。
對於思覺失調症，最好的治療辦法是藥物、心理諮詢和自助三管齊下。思覺失調症的治療主要靠藥物，抗精神病藥物改變了思覺失調症病人的生活，使他們可以繼續融入社會，而不是住在精神病院裡。
不管是否有症狀，病人必須一直服藥，否則就會症狀復發，藥物會有嚴重的副作用，加上病人自己不認為有病，使得大部分病人在服藥的第一年內停藥，因此思覺失調症的治療取決於能否保證一直服藥。藥物只能控制妄想和幻覺，無法解決病人社交能力等方面的問題。
常用的治療思覺失調症的藥物有：理思必妥，比其他藥鎮靜的效果差，可能導致體重增加和糖尿病，但相比可致律和 Olanzapine ，這些副作用出現的機率要低； Olanzapine ，除了控制精神病症狀外，還有可能改善陰性症狀，但可能導致嚴重的體重增加，患糖尿病的風險高； Quetiapine ，同樣有體重增加和糖尿病的風險，但比可致律和 Olanzapine 低；齊拉西酮，體重增加和糖尿病的風險比其他藥低，但可能出現心律失常；可致律，用於對其他藥耐受的病人，可以降低自殺行為，但引起體重增加和糖尿病的風險很高。很多抗思覺失調症的新藥正在研發階段。
思覺失調症會將預期壽命減少10到25年，也是導致殘疾的主要原因，病人的自殺率也很高，因此不能輕視。如果親人或者自己被診斷為思覺失調症的話，一定要堅持吃藥，克服藥物的副作用，藥不能停。通過藥物和心理諮詢等治療手段，思覺失調症病人是能夠有一個正常的生活的。