椎間盤突出症有微創手術、開放手術，因為兩種手術的損傷大小不一樣，有時病人術後感覺也不一樣。一般常見的手術後遺症，很多病人可能會有腰部酸痛、下肢疼痛或麻木等情況。每個病人的術前情況不一樣，所以術後感覺也會不一樣。因為通過微創手術和開放手術，會損傷周圍的肌肉、椎板或黃韌帶等軟組織或骨骼，裡面會有出血，相對會有吸收的過程。
另外，術後或多或少會遺留沾黏，病人會有一定的後遺症。但如果術後有很好的治療或復健，絕大多數病人沒有特殊的後遺症。個別病人如果鍛煉不當，或不能夠很好的關注其它注意事項，可能會遺留一定的後遺症。
目前無論是椎間孔手術或椎體融合術均為較成熟的技術。手術治療後由於原來神經傳導阻滯還未完全恢復，病人可出現下肢麻脹、疼痛、無力或排便無力情況，均屬於正常現象，通常在術後3個月左右即可逐漸恢復正常，期間可配合復健治療以及適當功能鍛煉，如拉伸椎旁軟組織，促進傷口附近血液循環加快恢復。
病人本人和家屬術前最擔心是術後是否會癱瘓，從目前技術角度和醫生的操作分析，只要在常規技術直視下操作，腰椎手術後癱瘓機率較小。但是手術風險客觀存在，有時部分病人由於心理因素或自身體質原因產生術後腰背部疼痛，此種疼痛通常均在可忍受範圍內，可隨時間流逝逐漸恢復。
對於椎間盤突出手術，最嚴重的後遺症主要是導致脊髓以及神經根的損傷，從而導致腰部、臀部、腿部的疼痛明顯加重，並且損傷嚴重以後，病人臀部及腿部的疼痛是無法恢復的，後期很容易導致腿部肌肉的失神經支配，從而引起肌肉萎縮甚至出現下肢癱瘓的情況。
再就是開放性的椎間盤突出的手術，會導致椎間、椎板的缺失，如果椎板切除過多，或者是椎間棘突缺失過多，很容易導致脊椎的不穩定，從而後期引起椎體滑脫的情況。
再就是椎間盤突出的開放性手術，會切開脊椎部位的韌帶及關節囊，這種情況很容易導致韌帶及關節囊黏連、攣縮，從而引起後期腰部的疼痛。
椎間盤突出手術之後可能會出現下肢麻木、運動障礙等後遺症，這主要跟術前病情嚴重程度、手術方式及手術水平有關。
椎間盤突出的治療方法主要包括非手術療法和手術療法，一般情況下椎間盤突出病人採取非手術方法進行治療，如保守治療效果不好則需要採取手術方法進行治療，手術的核心內容在於對神經壓迫的解除，是否會出現後遺症與術前神經壓迫嚴重程度有關。
一般情況下，術前神經壓迫程度嚴重，如出現下肢感覺麻木、肌力下降，甚至部分癱瘓，術後遺留麻木、運動障礙的可能性大，對於神經壓迫程度較輕的，遺留上述症狀的可能性較小。另外後遺症的出現與手術水平亦有關係，比如術中減壓徹底程度、術中對神經的保護程度等。
患有椎間盤突出症，在採取手術治療後，多數的病人是沒有後遺症的，有少數病人可能會出現神經根的副損傷，比如自覺腰部有慢性疼痛、下肢皮膚麻木、肌肉力量減弱等情況。所以在病人術後需要進行初期、正確的功能鍛煉，可以進行小燕飛鍛煉方式，或者採用三點支撐、平板支撐等鍛煉方法。
在鍛煉時，應該在復健醫生指導下進行科學的鍛煉，可以避免發生腰椎部位出現意外情況。另外也可以在手術刀口部位採取熱敷治療，比如經常用毛巾熱敷、應用頻譜儀烤電，以及選擇紅外線治療儀治療，能夠減輕防止出現刀口部位的肌肉沾黏。