大部分甲床分離的病人可以自己好，極少部分可能出現嚴重的甲床和甲板分離，可能會影響癒合。外傷嚴重或合併其他疾病，比如銀屑病引起的甲板和甲床分離，如扁平苔蘚引起的甲板與甲床分離，還有真菌感染，俗稱灰指甲引起的甲板和甲床分離，自愈概率就比較小，通常需要用藥治療原發疾病才可以恢復。
如果有甲床分離的症狀，治療時應該先分清楚是哪一種情況造成，然後進行針對性治療。如果是由於外傷而造成的甲床分離，常見的因素有經常接觸刺激性東西，比如指甲油及洗潔精等。此種情況需要注意防止患處出血，需要使用優碘進行去消毒，避免出現感染的情況，然後等新的指甲長出來即可。
如果是由於真菌感染而引起，即灰指甲，病人需要進行抗真菌感染治療，需要口服斯皮仁諾進行治療，然後局部塗抹紅黴素藥膏進行治療。所以一旦患有指甲的甲床分離的情況，病人先要去醫院做真菌檢測，然後根據病因進行相應的治療。
甲床分離如果是局限性甲床分離，隨著指甲生長，在甲床貼合的部分能夠生長出來，則會自己好。但是甲床分離有時會合併感染和甲床破壞，導致分離越來越重，甚至出現指甲畸形，這時需要修剪或者拔甲治療。
甲床分離有時是由於甲下淤血或創傷導致局部分離，這種情況隨著指甲的生長和指端往遠端的退變出現逐漸癒合和修復，則可以自愈。
甲床分離由疾病導致，如真菌感染導致甲床破壞，在分離部位甲床形成了疤痕，甲床的分離並不能隨著指甲的生長而得以好轉，往往需要控制甲床下的疤痕或炎症，才能得到甲床的恢復。需要把分離部位做修剪，嚴重的甚至需要拔甲，並使用藥物或其它治療方法，才能使甲床好轉。
甲床分離比較廣泛時需要拔甲，如車門夾傷後引起甲下廣泛淤血，導致了甲床分離或者甲下損傷，出現這種甲床分離需要將指甲拔掉，用藥物控制感染才能治癒。