對於明確是細菌感染的喉嚨發炎，應使用抗生素，殺菌消炎治療，常用藥物有 Cefuroxime 、阿莫西林等抗生素。必要時可根據藥敏試驗選擇抗生素。對於上呼吸道病毒感染引起的喉嚨發炎，可酌情使用抗病毒藥，如 Acyclovir 、干擾素等。用於抑制病毒，促進機體復健。
除此之外，可使用一些具有清潔、殺菌作用的含漱液，有助於緩解因喉嚨發炎引起的疼痛、乾燥等不適症狀。常用的有複方硼砂溶液、呋喃西林溶液等。含漱時頭後仰、張口發啊聲，使含漱液能清潔到咽後壁。
若症狀非常嚴重，可酌情使用糖皮質類固醇，可短期用於消炎。如 Betamethasone 等。
還可用中成藥，如蒲地藍消炎片、西瓜霜等，對於喉嚨發炎引起的不適表現也有一定的緩解作用。
因喉嚨發炎主要使用一些抗感染藥物進行治療，這些藥物均有嚴格的適應症和禁忌症，故應在專業醫師的指導下用藥，切勿自行盲目使用。除藥物治療外，還可通過日常管理來減輕症狀和促進病情恢復，如注意臥床休息，儘量減少說話；多喝水，吃稀軟食物，禁菸酒，不吃辛辣和過於油膩的食物；保持穩定的情緒，避免焦躁等不良情緒等。
咽喉發炎以後針對不同部位用藥不一樣，咽部發炎以球菌多見，在細菌感染治療基礎上加用β-內醯胺類抗生素。如果喉部發炎可能β-內醯胺類效果不一定好，可以考慮用喹諾酮類的抗生素，主要針對細菌感染引起的發炎。
如果不是細菌感染引起的發炎，比如過敏因素，抗生素不管用。考慮抗過敏為主的藥物，比如抗組織胺藥物，以及抑制白三烯生成藥物等。
如果有食道逆流，比如常見的胃食道逆流，用抗生素或者抗過敏藥物沒有效果，要用抑制胃酸藥物，比如H2受體阻斷劑，或者PPI類藥物，以及增加胃動力藥物等，對咽喉不適發炎也有好處。
針對具體的症狀，還可以考慮用傳統的中醫中藥，對清咽潤喉、咽喉不適也有一定的緩解作用。但是前提一定要明確是哪種情況，具體選用藥物以後再用中醫中藥輔助治療，這是經常用到的方法。
喉嚨發炎可以吃抗生素藥物，但必須證實有細菌感染，因為大多數喉嚨發炎都是革蘭氏陽性球菌感染引起，所以用的抗生素用比較多，可能是青黴素或者頭孢類抗生素，較常見的青黴素類有阿莫西林、阿莫西林克拉維酸鉀等藥物，頭孢類有 Cephalexin 、頭孢丙烯、頭孢地尼、 Cefaclor ，頭孢一代、二代、三代的抗生素。如果對青黴素或者頭孢過敏禁止使用，可以吃紅黴素類藥物，比如阿奇黴素、克林黴素、克拉黴素等。
除抗生素外要對病人強調需要用漱口水漱口，把口腔里的細菌、病毒以及食殘渣及時沖洗乾淨，同時保持口腔衛生。如果以上藥物效果不佳可以同時用激素類藥物，比如用普米克令舒進行局部噴霧吸入，能夠讓激素直接作用於咽喉部，快速緩解病人咽喉部的腫痛。當所有藥物治療效果不佳時可以使用靜脈激素，如果病人有發燒、頭疼等症狀也可以使用解熱鎮痛藥，比如芬必得、泰諾林等藥物。