口腔的扁平苔蘚治療起來相對比較困難，因為口腔裡頭用藥比較不方便。還有扁平苔蘚在局部的時候，你會覺得你的飲食會受到很大的影響，刷牙的時候也會覺得很刺激。這時候可以選擇 Terbinafine 軟膏局部塗抹，也可以選擇中藥的口服，加上中藥的含漱液。
扁平苔蘚的形成主要是跟慢性的炎症刺激有關係的。可以用馬齒莧、生地榆、連翹、金銀花，把這幾味藥混合煮成湯水以後，每天早晨或飯後、飯前漱口。再一個就口服的中藥，這口服中藥在治療過程中，對扁平苔蘚還是以清熱解毒、活血化瘀為主。
對於扁平苔蘚大部分治療能夠在一年左右能夠復健。當然有的時候也是跟有些物質刺激有關係，比如說假牙。那這個假牙儘量修一些比較合適的，減少對局部皮損的刺激反應。扁平苔蘚的形成往往是跟自身免疫相關的，比如說建議大家，可以口服轉移因子口服液或者是口服一些免疫調節劑，都能夠很好的治療扁平苔蘚。
扁平苔蘚是可以發生在皮膚、毛囊、黏膜、指甲等較少見的皮膚病。扁平苔蘚原因不明，為慢性炎症性皮膚病，通常表現為紫紅色、多角形、扁平狀丘疹，表面會有蠟樣光澤，境界清楚，搔癢比較明顯。治療本病首選藥物是糖皮質類固醇，能夠使損傷和炎症得到及時控制，一般比較嚴重的皮疹可以選擇小劑量激素口服或者外用糖皮質類固醇藥膏。
目前臨床上有病人使用鈣調磷酸酶抑制劑等藥膏，也會使局部皮膚，包括外陰部、口腔部皮疹得到良好控制，要根據皮疹不同形態選擇不同等級藥物。糖皮質類固醇無效或者病情嚴重、皮疹範圍較大者也可以選擇其它系統藥物，如阿維A或者免疫抑制劑，如環孢素、 Thiopurine 等，都是比較強效的免疫抑制劑。
口腔扁平苔蘚是與自身免疫相關的皮膚-黏膜慢性炎症性疾病，主要表現口腔黏膜出現灰白色小丘疹或斑塊和相互交織的細條紋，常伴疼痛等。
一般治療要消除局部刺激因素，如煙、酒、牙結石、殘冠等，加強心理疏導、緩解精神壓力，如果有糖尿病、高血壓等疾病，需積極治療，如果懷疑是由於某些藥物的應用導致的，可以在醫生指導下用其他藥物或停藥。
藥物治療可以用乳酸依沙吖啶溶液或氯己定溶液漱口，起到消炎的作用，或外用 Tacrolimus 、 Pimecrolimus 塗抹，可用於改善嚴重病變，減輕疼痛。還可以選擇口服小劑量普賴鬆，具有抗炎、抗過敏、免疫抑制的作用。
對於長期糜爛、潰瘍、斑塊型等遷延不愈者進行追蹤觀察，必要時進行病理切片檢查或手術切除。
目前對口腔扁平苔蘚還沒有根治的辦法，因為扁平苔蘚是在口腔黏膜上出現樹枝狀和花紋的白色網紋，如果沒有症狀，不需要治療，給病人進行生活指導，如不要吃辣椒、生薑蔥蒜或麻、辣、燙，病人就能夠保持正常生活。所以得了扁平苔蘚不要緊，只要注意忌口就能夠正常生活。但還有病人出現了糜爛，不吃東西也會疼痛。在這種情況下，首先選擇局部治療，可以給 Triamcinolone Acetonide 口腔膏或復健新液漱口，在病損部位可以塗藥。
如果更加嚴重，在嘴裡出現了好幾處糜爛，需要吃免疫調節藥，在醫生指導下來用藥。儘管還不能根治扁平苔蘚，只要大家保持良好心態、生活規律、加強鍛煉、不要吃辣椒、生的姜蔥蒜、注意口腔衛生，就能夠像正常人一樣生活和工作，其中還有部分病人有可能恢復正常。放鬆是治療扁平苔蘚的良藥，緊張是促進劑。