骨髓穿刺前會行局部浸潤麻醉，有疼痛，但絕大多數病人可耐受。
骨髓穿刺是臨床上常用的採取骨髓液的一種有創操作，主要用於各種血液疾病的診斷、鑑別診斷、治療效果評估，以及檢測某些寄生蟲，如瘧疾、黑熱病等。
骨髓穿刺部位常取髂前上棘、髂後上棘、胸骨柄、腰椎棘突。雖然這是一項有創檢查，但由其於操作簡單，骨髓液抽取量較少，對病人並不會造成特別的損傷及影響。
骨髓穿刺操作前大多數會行局部麻醉，由皮下至骨膜逐層浸潤，這些當由有經驗的醫生操作時，病人有輕度疼痛。
但存在兩種情況，首先在麻醉針刺破皮膚時，部分病人會有疼痛感；另外在抽取骨髓液時，由於髓腔負壓作用，病人會有輕微的酸脹、疼痛感，這些症狀在經過平臥休息及肢體制動後均可有效緩解。
骨髓穿刺屬於有創操作，必須由專業醫生進行。
病人在進行骨髓穿刺的時候，會產生輕微的疼痛的感覺，因為在局部的麻醉之後，骨髓穿刺會通過皮膚刺入骨髓，由於是在麻醉的部位進行，所以說病人此時不會產生疼痛以及其它的不適感覺。在穿刺針回抽骨髓液時，由於負壓吸引作用，病人會有輕度酸痛感，但是對一般來說，病人是可以耐受的。如果是病人對疼痛比較敏感，可能會感覺到會出現一些疼痛。
骨髓穿刺的方法很簡單，一般是髂前上棘或髂後上棘，局部注射少量麻醉藥，用骨髓穿刺針抽取0.2～5毫升骨髓組織就可以了。一個熟練的專科醫生操作骨髓穿刺的全部過程不過幾分鐘。
骨髓是成人造血的重要部位，每天都在不斷更新，抽取0.2～5毫升用於檢驗，對身體沒有任何影響，也不會引起遠期損傷。