如果子宮內膜在病理狀態下持續較薄，可能影響懷孕。子宮內膜薄可由於結核桿菌感染，導致子宮內膜破壞。有時可因多次進行人工流產、診斷性刮宮、子宮內膜搔刮術，在這類手術創傷的狀況下，對子宮內膜，尤其是子宮內膜的基底層，會造成一定破壞。此時如果無足夠的荷爾蒙給予相應修復，短時間內可導致子宮腔沾黏。一旦形成子宮腔沾黏，可導致月經量明顯減少，甚至子宮原因的停經，以及不孕症。
因此，子宮內膜太薄不僅影響月經，還可影響後續懷孕。但女性子宮內膜在月經的不同時間點有不同厚度。例如生理狀態下，月經剛結束，或即將結束時，為整個月經週期中子宮內膜最薄的階段，此時僅有0.3-0.4公分，大多為正常，無需過於擔心，並非有疾病。
隨著卵泡的生長發育，隨著雌激素水平的分泌，子宮內膜受到雌激素影響，逐漸變厚，月經前達到子宮內膜最厚階段。此時的子宮內膜厚度通常達到1公分，甚至1.5公分。因此如果發現子宮內膜薄，無需過於擔心，應根據每個女性不同的年齡，不同的月經時間點，以及平時的月經量等，進行綜合分析。
正常子宮內膜的厚度在整個月經週期中不同，女性在剛來月經時，也就是子宮內膜剛脫落進行修復，子宮內膜比較薄，一般在4-5mm。隨著月經時間的延長，子宮內膜會逐漸增厚，在下次月經來之前子宮內膜厚度達到最高值，一般在10-13mm。此時如果子宮內膜低於正常值，就考慮為子宮內膜薄的狀況。
由於子宮內膜薄只是一種形態學改變，女性雖然有子宮內膜薄，但子宮內膜功能正常，對懷孕影響比較小，女性可以正常懷孕。女性如果出現過人工流產、刮宮手術、子宮內膜搔刮術等，導致子宮內膜變薄。由於子宮內膜是胚胎著床以及生長發育的場所，所以子宮內膜的功能狀態直接影響到胚胎。子宮內膜要與胚胎發育同步，胚胎才能夠著床到子宮內膜上。一旦出現體內荷爾蒙分泌不足，沒有達到良好的修復，可能會出現子宮腔沾黏，影響懷孕，甚至出現不孕症。
所以在評估子宮內膜厚度時，一定要在下次月經來之前評估，因為只有在子宮內膜最厚時，才能釐清子宮內膜的厚度。如果女性懷孕以後黃體功能不足，黃體素分泌低下，對胚胎也會有一定影響，會引起胚胎生長不良或者發生流產。建議女性及時前往醫院進行相關檢查，在醫師指導下進行積極治療，以及選擇合適的懷孕方法。