一般情況下，拉肚子可以吃益生菌進行輔助治療的，但建議最好在醫生的指導下服用。
腹瀉是常見的消化道症狀，多見於急性腸炎的病人。急性腸炎多於夏季及秋季發生，病人首先應注意飲食的調整，應該儘量吃一些溫熱、稀軟、易消化的熟食，避免進食辛辣、刺激、油膩、生冷、不易消化的食物。腹瀉明顯時，首選服用腸道益生菌以及蒙脫石散等藥物，對症治療。在有明確細菌感染證據，如合併有血白血球、嗜中性白血球百分比明顯升高，或是大便中可見大量白血球，這些明確細菌感染證據時，首選針對革蘭氏陰性桿菌的抗生素類藥物，抗感染治療。如果沒有明確的上述細菌感染證據時，應避免濫用抗生素類藥物。
拉肚子的時候主要是注意飲食，清淡流質飲食為主。一定注意檢測病人體溫，當腹瀉量大的時候也要注意輸液補液，防止脫水。
拉肚子可以服用益生菌。服用益生菌時，說明書中常提示此藥既可以治療便秘，也可以治療腹瀉。益生菌是調節腸道內環境、腸道運動功能的重要細菌，能維持腸道正常pH值狀態，調節腸道內多餘氣體的化學轉換，同時能維持腸道正常滲透壓、蠕動功能。
便秘病人服用益生菌後，可以改善腸道內動力，包括腸道內滲透壓，可以使大便以合適狀態排出體外。此時的作用是調節大便不干，處理腸道蠕動功能，治療便秘。腹瀉病人服用益生菌後，能抑制有害菌對腸道黏膜刺激，發揮協同抗感染治療的作用。發生急性腸胃炎時，除抗生素治療外，可以服用整腸生類益生菌，進入人體後在腸道內發揮抑制有害細菌的作用，能加速腹瀉症狀緩解。
益生菌可以用於治療腹瀉，而且常作為腹瀉治療的首選用藥。
因為益生菌可以起到調節腸道菌群失調的作用，可以抑制腸道的致病菌，抑制腸道的炎症反應，所以可以起到緩解腹瀉的作用。另外，益生菌還具有一定提高機體免疫力的作用，還可以促進營養物質的消化、吸收。
益生菌幾乎不存在毒副作用，所以適用於廣大的病人，包括孕、產婦以及小兒。具體的益生菌選擇以及藥物的用法、用量，可以諮詢專科醫生。病人存在腹瀉症狀或者出現腸道菌群失調時，可以首先選用益生菌治療，必要時可以到醫院就診。