褪黑激素主要是用於治療失眠人群，但褪黑激素是不可以長期服用。長期使用褪黑激素是會使人產生藥物依賴性和耐藥性，所以服用褪黑激素的同時還需對每天服用的劑量進行限制。
長期服用褪黑激素還會致使內分泌失調，影響激素的分泌，對機體有不良的影響，造成很多不良症狀出現。如果是在備孕期間服用褪黑激素，還會影響備孕的效果，而且長期服用褪黑激素還會造成不孕症的情況。
所以，服用褪黑激素的人群需要注意，尤其是體制比較敏感的人群，需要注意服用褪黑激素同時不可以攝入酸辣、辛辣、冰凍等刺激性食品，以免引起腸道的不適，以及出現和藥物作用衝突的情況。
褪黑激素不可以長期吃，也不建議作為失眠的治療藥物。
褪黑激素不可以長期吃，長期大量吃褪黑激素可能影響機體正常分泌褪黑激素的功能，引起睡眠功能失調。過多服用褪黑激素，易使人精神不佳，睏倦欲睡。
褪黑激素是哺乳動物大腦中松果體分泌的一種激素，人體中褪黑激素的分泌是晝低夜高的，凌晨2點左右會達到分泌高峰。褪黑激素雖然具有催眠作用，但是相關的臨床研究證據有限，效果不理想，目前不作為治療失眠的常規用藥。但臨床上會使用褪黑激素受體激動劑治療以入睡困難為主訴的失眠，和晝夜節律失調性睡眠障礙。部分人容易將褪黑激素與褪黑激素受體激動劑混淆，誤以為褪黑激素治療失眠效果好而長期服用。
目前市售的褪黑激素歸屬於保健品，不能替代藥物用於治療失眠。