牙齒色素沉澱多是由於不注意口腔衛生或飲食習慣不良所致，首先需要多喝水、勤漱口，因為水分可以帶走牙齦中多餘的色素、殘渣、細菌，使口腔保持在一個相對清潔的環境中。其次要避免濃茶、濃茶、醬油等色素較重的物質攝入。菸草等物質不僅危害健康，菸草燃燒時產生的煙漬和污垢會沉著在牙齒上，導致牙齒色素沉澱，所以戒菸也是去除牙齒色素沉澱的有效方式。
利用超音波震盪的技術，可以有效的去除牙齦上的碎石、殘渣、同時可以帶走少量的色素以及菌斑。該方法可以起到很好的美白效果，其特點是高效高速，安全無副作用。噴砂潔牙則是在超音波潔牙的基礎上，利用高壓氣流將特製的噴砂牙粉噴射到牙齒表面進行清理，因此噴砂潔牙可以更加充分地去除牙齒表面的色素、污垢、煙漬等物質。
色素牙齒去除色素的方法，應根據產生色素的原因不同而採取不同的方法去除。常見的比如平時牙齒比較白，隨著進食，有煙斑、色素、茶漬等這些色素的沉積，去除的方法比較簡單，通過洗牙、潔治和拋光就可以去除外源性的著色。
但是牙齒也有可能是內源性疾病所引起，比如常見的有氟斑牙或者是四環素牙，都表現為牙齒發黃、發灰，這兩種疾病去除的方法則不能通過簡單洗牙去除，可以通過雷射美白或者冷光美白的方式去除色素，也就是提高亮度。
但是由於氟斑牙或者是四環素牙的亮度很難提高，如果對美觀不滿意，也可以採取貼面修復的方式，需要磨除牙齒表層的釉質，然後製作貼面覆蓋掉以後牙齒會變得亮白。普通外源性著色的牙齒去除方法，通過洗牙就可以。
如果吃了有顏色的食物或者藥物，非常關鍵的就是通過有效的刷牙來清潔牙齒，從而防止色素沉澱在牙齒上。
如果在吃完有顏色的食物或藥物後，沒有及時清潔牙齒，或者沒有徹底清潔牙齒，色素可能已經頑固的附著在牙齒表面，不能通過刷牙去除。此時病人應該到專業的醫療機構就診，醫生會通過拋光、噴砂等特殊的臨床技術，去除牙齒表面的色素分子。此外，在治療後，病人應該加強口腔衛生的清潔，從而避免色素的進一步沉著。
牙齒色素沉澱指的是外來的色素沉積在牙齒表面上的現象。臨床上，很多家長會向醫生反饋，孩子的牙齒有色素沉澱，且不能通過刷牙去除。此時醫生通過詳細的詢問病史，就可以發現此類孩子通常都有口服過中成藥，或者吃過帶有色素的食物的情況。