一般情況下，胎兒的中樞神經系統在孕12週左右後會進行發育，因此甲狀腺低下的孕婦通常在懷孕12周後才能判定胎兒智力。
甲狀腺低下是由於環境、遺傳等多種因素導致甲狀腺激素的合成、分泌等受影響，使甲狀腺激素出現不足的一種內分泌類疾病。輕度的甲狀腺低下對胎兒智力影響較小，但是中、重度的甲狀腺低下可能會影響胎兒的智力發育。而胎兒智力發育時間是12週之後，且到孕12週左右，胎兒的甲狀腺即可合成甲狀腺激素，如果胎兒從母體獲得的甲狀腺激素不足，自身合成也不足時，可能會導致胎兒生長發育遲緩，進而可能會影響胎兒智力發育。此時可以通過分析甲狀腺激素的水平，從而判斷胎兒的智力是否存在問題。如果通過檢查發現孩子的智力存在問題，可以進行進一步的檢查，根據檢查結果以及醫生的建議，選擇是否終止妊娠。
妊娠期如果發現甲狀腺功能不足，尤其是甲狀腺刺激素開始升高，這時候要及時做治療。大量文獻資料提示甲狀腺低下未治療的對母嬰影響比較大，最主要的問題就是影響胎兒的整體發育，如果是沒有治療的甲狀腺低下，會影響胎兒整體的發育，甚至會引起胚胎萎縮。
甲狀腺低下如果沒有糾正，還會影響胎兒的神經系統發育，尤其在妊娠初期。由於妊娠期無法判斷孩子神經系統的發育情況，通常要等到小孩6-12歲以後才能測定智商，此時孩子的智商指數可能要落後於其它的兒童，所以妊娠期要及時糾正甲狀腺低下。
甲狀腺低下懷孕會造成胎兒腦發育障礙，孩子智力下降。
妊娠10-12週之前胎兒甲狀腺不能聚集碘，20周之前胎兒甲狀腺不能合成和分泌甲狀腺激素，完全依賴母體T4少量穿過胎盤以維持胎兒甲狀腺功能。
甲狀腺激素是促進蛋白質合成的重要激素，對胎兒腦神經發育起著至關重要的作用。
20周前是胎兒腦神經發育的關鍵期，一旦母體缺乏甲狀腺激素，胎兒自身無法合成，亦無法從母體獲得，便會導致胎兒大腦神經蛋白合成障礙，腦內蛋白質含量減少，細胞體積減小，影響腦發育。
因此，建議所有備孕女性常規行甲狀腺疾病篩檢，發現異常，積極治療，使甲狀腺功能維持在正常水平，保證孕期胎兒正常發育所需。
妊娠期甲狀腺低下會對胎兒的中樞神經系統發育造成顯著的影響，有研究顯示在妊娠初期如果孕婦出現甲狀腺低下，新生兒出生後兩歲其神經、智力發育評分比正常孕婦子代低8-10分。
動物研究發現，母屬甲狀腺低下會對子屬的大腦皮層神經元發育相關蛋白CREB，信號傳導通路造成抑制，最終體現在神經元發育異常，因此孕婦如果在妊娠初期，尤其是妊娠4-12週發生甲狀腺低下時，應儘早給予左旋甲狀腺素干預，糾正甲狀腺低下狀態，以免引起新生兒子代智力發育異常。