加味逍遙散不主張長期服用，服用時間根據病症而定，用於疏肝解郁，一般1-2週即可見效。治療乳腺增生或月經失調，可在醫生指導下服用3-5個月均可。
加味逍遙散作為經典名方較安全，臨床上較少有報導嚴重不良反應。病人服用其疏肝解郁、改善情緒時，一般1-2週即可見效，如服用一個月還不見明顯療效，建議停止用藥，諮詢開方醫生。如女性病人用治療乳腺增生或月經失調，脅肋脹痛方面病症，在醫生指導下服用3-5個月均可。因其是丸藥，中醫講丸者緩也，藥效發揮會較緩慢，且又因每個病人體質和用藥時病情輕重不同，病人服用加味逍遙散時並沒有一個明確時間限定。其屬於疏肝健脾、理氣解郁的藥，臨床上用治療肝胃不和、肝脾不和引起胸部脅肋部脹痛、頭暈目眩、不思飲食、月經失調等病症均有效。
在使用加味逍遙散治療期間，病人需要注意如果出現嚴重的腹脹、腹痛，應當及時前往醫院就診。用藥期間如果出現月經不規則或陰道不規則出血，應當及時停藥並前往醫院就診。用藥期間病人需要儘量保持自己情緒樂觀，避免暴躁易怒、生氣等行為影響藥物的治療效果。
如果疾病比較嚴重，是可以較長時間服用加味逍遙散的，但建議提前諮詢醫師，在醫師指導下合理使用藥物治療。如果症狀輕且已完全恢復，那麼就不要再繼續服用加味逍遙散了。一般情況下服藥三天症狀就會有一定的緩解，如果症狀不見好轉，可能是藥不對症，不要再繼續服用，應到醫院就診，以免耽誤治療。加味逍遙散為藥品，雖然在臨床應用中沒有嚴重不良反應的報導，但是是藥三分毒，健康的人群不可將其作為日常保健品長期使用，以免發生嚴重的毒副反應。
中醫認為肝主舒泄，能調節情志，情緒低落、心情憂鬱、生悶氣等很容易影響肝的功能，繼而可能引起一些身體上的不適。所以平時生活中，要學會調節、傾訴和發泄自己的不良情緒，不開心的話可以找朋友家人聊天，經常出去走走散散心，多參加戶外活動，如爬山、跑步、游泳、騎行。並注意調整自己的生活習慣，早睡早起，不熬夜，均衡飲食，不過度節食和暴飲暴食等。
柴胡、當歸、白芍、茯苓等等是組成逍遙散的中草藥，主要是用來舒肝健脾、養血調經。中成藥的安全性要好於西藥，可以簡單的理解成西藥是把中成藥裡邊的有效成分提純，提取以後單一的成分，劑量和發揮的療效就大大提高，所以導致不良反應也會增加。中成藥通俗來講就是簡單的藥食同源，不良反應相對要少一些，但是也不是沒有，只能說比西藥要少一些。
從藥物的安全性來說，長期服用似乎相對安全。但是有一個問題，長期服用一定有原因，如果單是為了疏肝健脾、養血調經，這個疾病治療建議定期複查，定期複診，就是治療一段時間要有一個複查，由醫生判斷是否繼續服用這個藥物，或者繼續以同樣劑量來服用。只有經過多次複診以後，疾病才會得到規範的診治。
相反，如果不是定期複查，自作主張長期購買、服用這個藥物，即使是剛才所說的沒有什麼安全隱患，但是也會造成一定耽誤疾病的診治。比如月經失調，一些問題如果沒有得到及時、規範的診治，因為有的時候月經失調可能是內分泌的原因，這個時候就不是安全的問題，會可能耽誤疾病。不建議自己長期使用逍遙散，一定要在規範的醫療機構接受規範的診療，在醫生的指導下來使用這個藥。