囊腺瘤不嚴重，囊腺瘤本身是良性病變，無論是漿液性囊腺瘤，還是黏液性囊腺瘤，單純的囊腺瘤都是良性病變。但是令人擔心的是交界性囊腺瘤，即意味其可能有細胞異型，當異型特別多的時候，就擔心其有可能復發。
因此這種狀況要釐清病理，即是單純的囊腺瘤，還是交界性囊腺瘤，處理的方案其實也不一樣。例如是單純的囊腺瘤，無論是漿液性的還是黏液性的，都可以進行局部囊腫的摘除，正常的卵巢可以完全保留。
如果交界性囊腺瘤，還是應該持保留的態度，因為畢竟以後有可能復發，甚至往惡化生長、發展。因此這種狀況要釐清病患的年齡，以及生育狀況，如果病患比較年輕，還是相對保守，即可能還要將囊腫切除，正常卵巢保留，尤其是尚未完成生育的病患，可能處理更為保守。
但是如果年齡比較大，例如都已經40多歲、50歲，且已完成生育功能，可能就要將這一側的附屬器，包括卵巢和輸卵管都一併切除。因為如果是交界性囊腺瘤復發率還是很高的，為了預防復發，為了擔心日後惡化，所以就預防性地將這側的卵巢切除。
卵巢囊腺瘤是否嚴重，第一是取決於其性質，有一些可能是卵巢的漿液性囊腺瘤，有一些可能是卵巢的黏液性囊腺瘤。而且在釐清診斷卵巢黏液性、漿液性囊腺瘤基礎之上，還應該釐清是否有癌化。
有時候可能會出現卵巢上皮細胞腫瘤的惡性轉變，也就是這種狀況下，就不應該被稱之為囊腺瘤，而應該被稱之為囊腺癌。有可能是來源於卵巢的漿液性囊腺癌，還有可能是來源於黏液性囊腺癌。
如果是提到惡性腫瘤，通常狀況下這種卵巢的惡性腫瘤術後會需要給予相應的化學治療，甚至給予全身的綜合治療。但是如果已經排除惡性腫瘤，確實就是良性的，無論是漿液性囊腺瘤還是黏液性囊腺瘤，都是良性的病變。
不過從臨床上來看，漿液性囊腺瘤術後，如果能夠保護得特別好，大多數的狀況下，再復發的風險並不是很高。但是如果涉及到卵巢黏液性囊腺瘤的時候，有時候在臨床上是能夠看到反覆的播種性發作的。
這種反覆性的發作實際上是與在進行手術的過程中，可能會出現黏液性囊腺瘤局部組織潰破，可能會出現局部的播種性轉移。甚至有時候可能會多次進行切除，如果是多次進行開腹或者是腹腔鏡的腫瘤切除之後，勢必會造成越來越多的沾黏。
這種越來越嚴重的沾黏，可能在未來後續的手術中造成更嚴重的併發症。有時候可能會導致腸阻塞，有時候可能會因此而喪失生命。因此關於女性卵巢的囊腺瘤，首先需要排除是否有囊腺癌的存在，是否有惡性腫瘤的存在，即使是良性的腫瘤，也需要判斷其性質是漿液性的還是黏液性的，一旦出現復發，也需要積極給予相應處理。