導致脊椎骨疼痛的原因較多，比如脊椎退化性改變，其多見於中老年病人，常見的退化性病變部位如頸椎、腰椎，由於上述部位長時間負重，或長期慢性勞損，易出現退化性改變，如長時間低頭、枕高枕頭、久坐、彎腰工作等導致脊椎退化性改變。可引起局部骨質增生、椎間隙變窄、韌帶增生或肥厚、椎體不穩等，從而導致病人出現脊椎骨性疼痛。
比如脊椎炎症性病變，如化膿性炎症、脊柱結核，造成骨質破壞、椎間盤溶解、脊椎不穩，也會誘發脊椎疼痛。此外，非化膿性炎症或無菌性炎症，如自身免疫性疾病，包括僵直性脊椎炎、風濕性脊柱炎，也可導致脊椎骨頭、韌帶、椎間盤的無菌性炎症反應，誘發較嚴重的疼痛。
比如腫瘤性病變，脊椎的原發性腫瘤如骨母細胞瘤、骨巨細胞瘤，以及惡性腫瘤如骨肉瘤、淋巴瘤、骨髓瘤、轉移瘤，可造成骨頭大量溶解、破壞，從而誘發局部疼痛。同時可伴有全身症狀，如貧血、消瘦、乏力等。
造成病人脊椎骨疼痛的原因較多，如果出現上述症狀，病人應儘快到醫院就診。通過脊柱外科醫生的專業檢查，配合輔助檢查，可明確診斷後針對性進行處理，以免貽誤病情。
在門診能夠診斷脊椎疼痛的疾病非常多，因為脊椎既包括頸椎、胸椎、腰椎，還包括骶尾椎。因為產生這些位置疼痛，包括的疾病可能既包括外傷，也包括慢性疾病，最常見的原因往往是因為長期姿勢不良，比如久坐、低頭伏案工作，引發頸腰椎的不適。
因為頸椎、腰椎是整個脊椎裡面活動度最大的兩個部位，活動度大、活動多，發生症狀可能也會相對頻率高。除去長期姿勢不良引發的肌肉勞損，無菌性炎症會造成頸椎疼痛之外，還有比較少見的比如腫瘤，很多在脊柱或有其它的惡性腫瘤轉移到脊柱上邊。另外，一些免疫科的問題，比如僵直性脊椎炎，可能會引發頸胸腰椎，甚至薦髂關節、骶尾椎的不舒服。
臨床當中引起脊柱疼痛常見的原因還是比較多，根據疼痛的類型和來源不同，通常分為以下幾種。
第一是軟組織來源的脊柱疼痛，臨床上也是最為常見的一類因素，主要包括腰肌勞損、肌肉的肌筋膜炎、韌帶炎、韌帶損傷等，比如長期的久坐、伏案工作容易產生腰肌勞損而引起的腰部的損傷，搬重物不當則容易引起腰扭傷，或者是由於局部的韌帶產生棘上韌帶炎等都可以表現為脊柱的疼痛。
第二是關節突源性的脊柱疼痛，一般病人多見於中、老人，往往伴有的小關節的退變、增生，或者是長期久坐的人群容易有此類的原因，由於關節突的增生和穩定性受損，引起關節突源性的脊柱的疼痛。
第三也是比較常見的一種類型，就是退變性的脊柱疾病，是最為龐大的一類腰椎疼痛的疾病，如腰椎退變性的側彎、滑脫、狹窄以及的腰椎的不穩定等，都可以導致脊柱的疼痛。
第四是一些脊柱炎、風濕免疫科的疾病等，比如強直性脊柱、血清陰性的脊柱炎等，疼痛大多有明顯的晨僵的病史。