藥流之後只要身體恢復的很好、子宮內膜正常，還是比較容易自然懷孕的。絕大部分的藥流不影響下次正常懷孕，藥流一般不需要清宮，通過吃藥就能夠把孕囊排出來，在產後流血的時間會稍微長，所以一定要注意流血的情況，預防感染。如果流血長時間不乾淨，要及時進行就診。
另外，藥流之後建議適當吃促進子宮內膜修復的藥物，可以促進內膜修復，使月經恢復正常範圍，對下次懷孕的影響也會變少。雖然大部分情況下不影響再次懷孕，但建議還是要少做或者不做藥流，因為任何方式的流產，都可能會對身體造成影響。而且做的次數多，容易引起婦科的炎症、輸卵管阻塞等，會降低懷孕概率。如果沒有生育要求，就要做好避孕措施。
絕大多數的藥物流產不會影響下次的懷孕，如果單純的藥物流產，服藥以後胎囊組織快速的完全的排除，產後恢復良好，通常不會對下次妊娠有負面的影響。
但是如果出現感染、不全流產需要清宮等，通常會導致或增加子宮內膜損傷的機會。由於子宮內膜的損傷，特別是損傷到子宮內膜的基底層，而使子宮內膜失去正常的解剖形態與生理功能，使月經稀發或閉經，受精卵不能有較好的生長發育與著床的宮腔環境，一定會影響下次的妊娠。由於感染導致的骨盆腔的炎症，引發輸卵管的炎症，導致輸卵管的功能減弱或輸卵管的梗阻不通，會導致生育能力的下降、不孕或子宮外孕的發生概率。
藥物流產之後絕大部分還能正常懷孕，但是有一部分如果出現相應的合併症，就可能影響今後的懷孕。
如果在藥物流產之後沒有按著醫囑正常休息，過於疲勞，導致機體抵抗力下降而引起骨盆腔感染，導致輸卵管沾黏，就可能影響今後懷孕。另外藥物流產之後如果還要進行清宮手術，而清宮手術又傷及子宮內膜基底層，引起宮腔完全沾黏或者是不全沾黏，對今後懷孕都可能造成影響。如果藥物流產之後過早地性生活，導致陰道炎、子宮頸炎、子宮內膜炎等，對今後的懷孕也會造成影響。
所以藥物流產之後，一定要聽從醫囑適當休息，加強營養，避免在1個月之內有性生活。同時要加強外陰局部的護理，才有可能平安地度過藥物流產的階段，減少今後對懷孕的影響。
藥物流產之後是會影響生育的，雖然沒有進行宮腔的操作，但是通過藥物的方式來進行了一次內膜診刮，由於藥物的影響，可以引起輸卵管的一些炎症，子宮內膜炎症的發生。甚至由於在藥物流產的時候，出血時間比較長，在7-10天左右，在這齣血期間，如果沒有進行及時的炎症控制，可以造成上行感染，造成輸卵管增粗、沾黏，甚至會引起子宮內膜炎症、骨盆腔炎症和子宮頸炎症的機率發生。
所以在進行藥物流產的時候，一定要按照醫囑來口服消炎藥物和活血藥物，來幫助把宮腔里的組織進行排出，避免時間長會造成感染傾向，也會影響生育的健康。同時在以後生活當中，一定要做好避孕的措施，沒有備孕打算，還是以保險套的方式進行避孕，以免意外的懷孕，頻繁次數多的藥物流產，也可以造成不孕的機率。