肚子脹痛根據不同的部位，其原因各有不同。如果是左上腹脹痛，要考慮與胃相關，比如慢性胃炎、消化性潰瘍或者是胃部的腫瘤。當胃部出現這些病變時會導致胃黏膜受損，或者胃動力下降導致左上腹脹痛，這種情況可以通過照胃鏡檢查明確診斷。
如果是右上腹脹痛，要考慮肝膽方面的疾病，比如膽結石、膽囊炎、慢性肝炎、肝臟的腫瘤等。當進食油膩食物時，會誘發膽結石以及膽囊炎，會出現右上腹明顯的脹痛。如果肝臟有炎症和腫瘤性病變會刺激肝包膜，導致右上腹脹痛，對於右上腹脹痛，可以通過上腹部的CT和核磁共振檢查來明確原因。
如果是下腹部的脹痛，要考慮腸道疾病有關，比如急慢性的腸炎，潰瘍性結腸炎，以及腸道的腫瘤。因為腸道的炎症病變和腫瘤性病變，可導致下腹的脹痛，同時有排便不暢或者是大便次數增多，黏液膿血便等等情況，對於這種情況可以通過做大腸鏡檢查來明確診斷。對於女性，如果有附件炎、骨盆腔炎也可以導致下腹部的脹痛，這時可以通過下腹部的磁共振，或者是超音波檢查來明確診斷。
肚子脹痛的原因眾多，需要結合脹痛的部位、其他臨床表現、輔助檢查等進行綜合分析。
腹部脹痛是臨床常見症狀之一，可以是功能性的，也可以是器質性的。功能性腹部脹痛相對來說，病情多不嚴重，不伴有全身症狀，通過短期的對症治療，症狀可以緩解。但若腹部脹痛短期內不緩解，並伴有全身症狀者，如腹瀉，噁心、嘔吐，發熱等，應考慮到器質性疾病的可能。器質性腹部脹痛的病因複雜，可為感染因素（如腹膜炎）、腫瘤因素（如胰臟癌）、也可為長期以來的炎性腸病因素（如克隆氏症）等。上腹脹痛應多考慮胃、胰臟、肝膽疾病等，下腹脹痛應多考慮腸道、膀胱疾病、女性的婦科疾病等，當然也不盡然。具體病因，需結合病史、其他臨床表現、實驗室檢查、超音波、消化道內鏡、CT和磁共振等影像學檢查，方能明確診斷。
引起肚子脹痛的病因有很多，臨床上較為常見的病因是腹腔內臟器炎症性疾病，或者是腸阻塞、臟器扭轉等。不同部位的肚子脹痛，病因不一樣。腹痛的部位，如果是右上腹的脹痛，常見的病因是膽囊炎、膽結石，或者肝膿瘍、肝內膽管結石等。
如果出現上腹正中或者中下脹痛，多見於急性或者慢性胃炎、胃和十二指腸潰瘍，以及胰臟炎等。如果出現全腹部的脹痛，比較常見的原因是腸阻塞。如果是右下腹的疼痛，有可能急慢性闌尾炎所引起。
性別不同引起肚子脹痛的原因也有所不同，一般臨床上出現小腹部的脹痛，大部分原因都是功能性腸胃障礙造成的腹部脹氣、腹痛等表現。對於女性而言，肚子脹痛考慮婦科炎症，如急慢性骨盆腔炎等。
出現肚子脹痛，建議病人去醫院行相關檢查，根據檢查結果才能行相對應的治療。