高血壓主要損害心臟和血管，初期可無明顯病理改變。長期髙血壓引起的心臟改變主要是左心室肥厚和擴大。而全身小動脈病變則主要是壁/腔比值增加和管腔內徑縮小，導致重要靶器官如心、腦、腎組織缺血。長期高血壓及伴隨的危險因素可促進動脈粥狀硬化的形成及發展。
1. 心臟長期壓力負荷增高，兒茶酚胺與ATII等都可刺激心肌細胞肥大和間質纖維化引起左心室肥厚和擴張，稱為高血壓性心臟病。左心室肥厚可以使冠狀動脈血流儲備下降，特別是在耗氧量增加時，導致心內膜下心肌缺氧。高血壓性心臟病常可合併冠狀動脈粥狀硬化和微血管病變。
2. 腦長期高血壓使腦血管發生缺血與變性,形成微動脈瘤，一旦破裂可發生腦出血。髙血壓促麵動脈粥狀硬化，粥樣斑塊破裂可併發腦血栓形成。腦小動脈閉塞性病變，引起針尖樣小範圍梗死病灶，稱為小洞性梗塞。高血壓的腦血管病變部位，特別容易發生在大腦中動脈的豆紋動脈、基底動脈的旁正中動脈和小腦齒狀核動脈。這些血管直接來自壓力較高的大動脈，血管細長而且垂直穿透，容易形成微動脈瘤或閉塞性病變。因此腦中風通常累及殼核、丘腦、尾狀核、內囊等部位。
3. 腎臟長期持續高血壓使腎小球內囊壓力升髙，腎小球纖維化、萎縮，腎動脈硬化，導致腎實質缺血和腎單位不斷減少。慢性腎衰竭是長期高血壓的嚴重後果之一，尤其在合併糖尿病時。惡性高血壓時，入球小動脈及小葉間動脈發生增殖性內膜炎及纖維素樣壞死，可在短期內出現腎衰竭。
4. 視網膜視網膜小動脈初期發生痙攣，隨著病程進展出現硬化。血壓急驟升高可引起視網膜滲出和出血。眼房檢査有助於對高血壓嚴重程度的了解。
因此，高血壓一般不會引起手指關節疼痛，手指關節疼痛一般可能是風濕免疫系統疾病，某些感冒等引起，建議去風濕免疫科就診。