兩隻眼睛大小不同的原因主要有生理性的眼球大小，還有發育異常的問題，是否是先天畸形。在正常的情況下，兩隻眼睛大小也不會完全一模一樣，如同10個手指頭不可能完全一樣，稍微有點不一樣也無妨，不可能完全一樣。還有一種情況，就是眼球是一樣大小。實際上是因為眼皮沒有抬起造成的一隻眼大，一隻眼小，屬於一種假性的大小不同。部分人眼瞼下垂，上眼皮沒有抬起，睜開的時候看著就是一隻眼大一隻眼小，此種情況需要進行手術治療。另外一種情況下，是真正的一隻眼大，一隻眼小，病人眼球發育異常，從出生就是病變造成的先天性小眼球，或者是由於外傷、病變造成的眼球變小、萎縮。
一般在正常範圍內，觀察到眼睛大小有點差異是無妨的。如果是睜眼困難造成的眼大或者眼小，就是由於眼瞼下垂造成需要手術矯正，將上眼皮矯正以後就可以恢復正常。如果是先天性發育異常或者其他病變引起的眼大眼小，主要是針對病因治療，但是也難以完全達到兩隻眼球一樣。
如果是先天性眼睛大小不一，屬於解剖結構異常，要根據幅度大小進行具體分析。如果視覺下大致正常，則無需處理。如果一側眼睛明顯變小，出現眼瞼下垂，則需要進行整形手術。成年人病人眼睛大小不一影響美觀時，可以用特製膠布貼將眼皮貼上去，也可以進行整形手術，擴大較小的眼睛。如果較大的眼睛出現異常，比如單眼眼球凸出，以及眼眶占位性病變也可導致眼睛大小改變，屬於病理性因素，需要到醫院進行明確診斷，進行下一步治療。
眼瞼下垂是孩子在視覺發育過程中，可能出現的發育性疾病，也是弱視產生的原因之一。當孩子眼皮下垂，上抬無力，耷拉的眼皮有可能擋住一隻眼球視線，影響眼球的視覺發育。嬰幼兒時期會出現眼睛大小不一的情況，需要明確眼睛是否受發育影響，必要時及時進行處理，也可通過採用眼瞼下垂貼或者及時手術治療。