腸胃炎病人高燒不退需要進行腸胃炎的治療，同時對高燒進行退燒對症處理。
腸胃炎的治療：病人首選要儘量臥床休息，可以口服葡萄糖電解質液，來補充體液的丟失。如果病人有持續嘔吐，需要靜脈補充5%至10%的葡萄糖鹽水，病人還需要多攝入清淡流質或半流質食物，以防止脫水。當然，腸胃炎最重要的就是積極的抗感染治療，常用的藥物是喹諾酮類，如左氧氟沙星、 Moxifloxacin 等。在使用藥物的過程中，要注意避免濫用抗生素。
退燒對症治療：針對發燒可以採取對症治療，如腋溫低於38.5℃的給予病人酒精擦浴、冰敷等物理降溫。腋溫超過38.5℃的，且物理降溫無效的，可以給予普拿疼、雙氯芬酸鈉栓等藥物退燒治療，這些藥物可能會引起大量出汗，所以要注意觀察血壓及出汗情況，及時補充足夠的液體。
腸胃炎一直發燒不退燒可以服用退燒藥物，如布洛芬等，也可以進行輸液治療。之所以這樣歸根結底還是炎症的原因，所以要進行急性腸胃炎的治療，儘量臥床休息，口服葡萄糖電解質液，以補充體液的丟失。
如果持續嘔吐或明顯脫水，則需靜脈補充5%至10%的葡萄糖鹽水及其他相關電解質，鼓勵攝入清淡流質或半流質食物，以防止脫水或治療輕微的脫水。必要時可注射止吐藥，抗菌素對本病的治療作用是有爭議的，感染性的腹瀉一些有針對性的抗菌素，比如口服黃連素，一日三次，或者是口服慶大黴素，一日三次。
但注意要防止自己抗菌素濫用的情況發生，保持食物，用具，容器，冰箱等食物保存場所環境的清潔，發生腐爛變質時一定不要使用，飯菜最好不要隔夜，瓜果蔬菜使用之前一定要清洗乾淨，飲食易清淡，儘量避免刺激性的食物，如辣椒、咖啡、濃茶等，同時還有避免藥物的刺激。