菌血症如果比較輕微，2週左右可以出現好轉，如果症狀比較重，可能需要20天左右才能恢復。
菌血症是指細菌，通過人體與外表接觸相通的通道，如呼吸道、破損的皮膚、消化道、尿路等進入人體的血液系統，並在人體血液內繁殖，隨血液流在全身播散。本病後果很嚴重，一旦確診應立即根據感染細菌的種類不同，爭分奪秒進行不同的抗炎治療，對於疑似發生菌血症時要立即進行採血檢查，感染的部位，包括感染的體腔、關節間隙、軟組織和病損的皮膚獲取膿液和體液，做革蘭氏染色和培養，選用合理的足量抗生素進行治療。
對於症狀比較輕微的菌血症，通過藥物治療，可能在2週左右出現好轉。對於老年性病人，比如併發嚴重的心腦血管疾病以及糖尿病、機體免疫力低下的病人，這種情況菌血症的治療要想達到徹底治癒，可能時間就會稍長，有的時間可能達到20天，甚至更長的時間。
考慮病人產生了菌血症，應及時抽血，明確感染的病原菌，並進行藥敏試驗，選擇敏感抗生素，抗感染治療。
單純菌血症使用抗生素治療至少14天，但如果合併局部組織或臟器膿腫形成，療程需要明顯延長，至少需要6-8週。通常感染部位不同，療程不盡相同，如骨組織感染，甚至可能需要半年或更長時間治療，治療同時還需要積極查找導致菌血症的原因與細菌來源。
菌血症指外界細菌通過體表入口或其他感染部位，進入血液中，可在血液中繁殖並隨血流在全身播散，在播散過程中可能出現遷徙性感染，如肝膿瘍、腦膿腫、肺膿腫、腹腔膿腫或骨組織的感染等。
如果出現上述情況，單純使用抗生素通常不能完全解決問題，甚至體溫控制也比較困難。此時需進行對膿腫部位穿刺引流，在充分引流的前提下，再應用適當抗生素，才能有效控制感染發生。如果形成局部臟器膿腫，療程會相對比較長，特別是合併骨組織感染或抗生素藥物較難達到部位，治療療程可能比6-8週更長，甚至需要0.5-1年。
菌血症由於病原性細菌侵入血液循環，並且其生長繁殖產生毒素，引起全身性感染，在人體免疫力下降時容易出現。如果觀察中發現病人的兩個不同部位都有抗陽性結果產生，並伴有相應的異常症狀，這時使用抗生素要會比較久，通常至少使用14天及以上。
如果機體是多個部位的感染，由於感染而引起的菌血症，而且有相應的較重的異常臨床症狀，這時使用抗生素還是要相對時間長點，通常要用至少两週時間。如果是由於感染性心內膜炎引起的繼發感染，而且經過血培養化驗為陽性，那麼臨床使用抗生素的療程要更長，有時甚至需要四週左右的。常規外科術後，無菌切口，或者是內置性的靜脈插管操作後，以及導尿管等相關性操作後而暫時未引起的短暫的菌血症，也無相應的臨床症狀，一般這種情況下是不必使用抗生素進行治療的。但是，病人需要注意應加強護理，多喝水，保證有規律的休息，以及生活方式的改變等。