眼袋手術分為兩種，手術方式不同，併發症或者後遺症也不一樣，兩種手術方式一種是內路眼袋，另一種是外路眼袋。
內路眼袋主要針對於年輕人，皮膚無需開刀，從結膜開刀去除脂肪，相對損傷小、恢復快，併發症相對少，常見的併發症後遺症是如果脂肪取得過多，可能會造成淚溝或下瞼凹陷，其它併發症相對較少，但所有手術都可能會發生出血、血腫、感染，但在正規醫院做，併發症的發生機率較少。
外路手術主要針對年齡大的病人，需要切除多餘的皮膚和脂肪，需在皮膚上做切口，切口會有疤痕，需要縫合、拆線，常見的併發症除了下瞼凹陷還包括下瞼外翻，如果切除皮膚過多則可能會造成下瞼外翻，還有一些手術切口相關的併發症，包括切口的疤痕、疤痕增生，也需要進行預防和治療，這些併發症和後遺症一般發生機率很低，只要到正規醫院去做，兩個手術都是安全的。
去眼袋手術是微整形，但也有注意事項。術後會引起組織周圍水腫，所以可能會出現眼皮周圍淤青，一般2週左右會慢慢消退。
也可能會出現結膜水腫，甚至突出在眼球表面，結膜組織水腫也會在2週到1個月左右消失。還有一些比較少見的併發症，尤其在不正規機構動手術，可能會產生比較嚴重的後遺症。
如果做內切口眼袋，可能會造成眼皮內翻、睫毛倒插。如果從外面做，皮膚外面有切口，此時去除過多脂肪反而得不償失，會顯老。如果去除臥蠶，笑時的表情也不自然。
如果外切口做眼袋時去除過多皮膚，導致眼皮外翻，也是非常嚴重的併發症，不僅影響外觀，而且會造成流眼淚、眼睛乾澀不適，這時必須到正規醫院做修復手術。所以建議如果做眼袋手術，也要去正規專業機構動手術。
眼袋切除手術，如果脂肪去除過多，就會引起局部凹陷的後遺症，如果皮膚去除過多，會引起眼瞼外翻的後遺症。內側切口發生上述情況的風險較低，因內側切口脂肪距離較近，適量去除就可以達到很好的手術效果。
外側切口因將整個皮膚和眶隔內徹底打開，脂肪容易去除較多，且在去除皮膚時，沒有對皮膚量進行適當把控，就會導致平臥位時去除眼袋效果較好，坐位時眼袋外翻，即下眼瞼結膜外翻到皮膚外。此種情況很難自行恢復，需要對眼瞼外固定錨著，手術創傷相對較大。
因此建議即使是眼袋手術，儘量選擇正規醫療機構進行，才能基本保證手術效果。部分求美者認為眼袋手術簡單，選擇非正規機構，比較便宜的費用，但術後不一定能達到和其他人一樣的效果。