右後腦勺一陣一陣的痛可能是神經性頭痛或者偏頭痛，也有可能是頸椎病等系統疾病引起的。需要根據自身的身體情況、頭痛發作的頻率、持續的時間以及其他症狀綜合判斷具體是哪一種疾病。
首先，有可能是神經性偏頭痛，是由於過度壓力，長期熬夜導致的這種情況，病人需要進行休息，在醫生的指導下，可以使用止痛藥。
其次，如果是頸部疼痛引起的後腦勺陣痛，有可能是由頸椎病引起，需要去醫院做具體檢查。如果出現頭暈、噁心、嘔吐等症狀，不排除有顱內病變的可能性。如果鼻塞，還有可能是由鼻竇炎引起的。
所以右後腦勺一陣一陣的痛這種情況需要到醫院進行CT和磁共振等檢查，才能查明具體原因。
左後腦勺一陣一陣的痛的病因可分為原發性和繼發性兩種。
原發性因素包括：緊張型頭痛和偏頭痛等。常常是由於緊張、勞累、壓力過大，睡眠不足等因素誘發。影像學檢查未見異常。緊張型頭痛往往是脹痛，而偏頭痛是反覆發作的跳痛。
繼發性因素包括：上呼吸道感染（感冒）、頸椎疾病、椎管內病變（如上頸段脊髓腫瘤、枕骨大孔區腫瘤）、寰枕部先天畸形（如顱底凹陷症、枕骨大孔狹窄、寰樞脫位）、損傷（如枕下關節韌帶損傷、寰椎前後弓骨折、寰樞椎半脫位、頸肌損傷等）。
如果休息後頭痛不能緩解，或者頭痛持續反覆發作，一定要到醫院完善相關檢查，明確病因並進行針對性治療。
後腦勺不管是右邊還是左邊出現疼痛，最大的可能就是枕大神經痛。
枕大神經有左右二支，主管後腦勺表皮上的感覺，一旦受到某種刺激，比如頸椎病、枕頭不合適、局部炎症、疲勞、肌肉病變等刺激了枕大神經根，會表現為發作性、陣發性扎痛、刺痛，由後向上有串電的感覺，所以就診斷是枕大神經痛，往往還可以同時有枕小神經痛。
頸椎病病人的頸源牲疼痛常常和枕大神經痛不容易鑑別，局部刺激是造成疼痛的原因之一，臨床上對治療枕大神經痛採取的都是止痛、鎮靜、神經營養、局部理療、針灸、按摩以及類固醇療法，預後還是不錯的，但在某種刺激下容易復發，所以應該注意預防。