高山肺水腫只要及時診斷處理，不會出現後遺症，且治癒後絕大多數人能繼續在高原工作。高原血壓異常者返回平原後無需治療血壓即可恢復正常，也不會出現後遺症。高原心臟病、高原紅血球症、高原昏迷等症，多數也能夠治癒。
重症高原心臟病病人轉低地後，病情雖有不同程度的恢復，然而部分病人心臟擴大且不易恢復。高原紅血球症病人合併有高血壓、高原性心臟病、腦出血和腦血栓時，則會遺留心功能減退、腦功能減退、肢體及語言障礙等後遺症。
極個別高原昏迷重症病例，由於腦細胞損害較重，或發生了腦出血，治癒後可以遺留視力模糊、記憶力減退等症狀。
在一般情況下，如果採取積極治療的手段，高山肺水腫是不會產生後遺症的。高原血壓異常者返回平原後無需治療血壓即可恢復正常，亦不會出現後遺症。反應症狀較重者，轉移到低海拔地區或平原後，症狀可迅速消失。因此，不管是急性高山症還是慢性高山症，一般都不會留下後遺症。
但是如果有以下幾種情況，就可能會有相關的後遺症出現：
在進入高原之前，要對當地地形氣候做充分的了解，逐步增加活動量，避免劇烈活動。當患上高山肺水腫之後，要及時下行，吸氧，進入正軌醫院治療。嚴格臥床休息及充分給氧，若能在短時間內送到低地則病情迅速好轉。如病情不宜長途運送則應就地積極搶救，包括持續給氧、腎上腺皮質激素、嗎啡、阿托品、四肢輪流縛止血帶、血管擴張劑、呼吸中樞興奮劑及消泡劑等。
一般來說，高山肺水腫病人應該多吃一些木耳、銀耳、扁豆、玉米、藍莓、桑葚、紅提葡萄等食物，這些食物對身體恢復都有一定的幫助。此外，病人還可以多吃一些對身體好的雜糧食物和調節生理的水果。並且，病人在運動中不能過度，因為如果過度運動很容易導致病情加重或者出現其他疾病。
高山肺水腫是由於急性嚴重缺氧，導致肺靜脈血管收縮，引起肺動脈壓急劇升高、肺血流量增加、通氣血流比例失調，且液體通過肺微血管漏入肺間質和肺泡，阻礙了正常的氣體交換的急性、惡性高原病，初期診斷、及時治療是治療該病的關鍵。
高山肺水腫的發病率為2%，病人近期到過海拔在三千米以上的高原地區，這些地方空氣相對稀薄，大氣壓和氧分壓較低。部分人在寒冷、勞累或者感冒等誘因下導致機體缺氧，不能耐受高原，嚴重的可以出現肺水腫。臨床上會出現靜息下呼吸困難、胸悶、咳嗽、咳粉紅色泡沫痰等，甚至有少尿、神志不清、面色紫紺等表現，聽診兩肺有濕囉音。拍胸部X光片是診斷本病的主要依據，胸部X光片表現為以肺門為中心的兩側出現雲霧狀的片狀陰影，呈瀰漫性不規則分布，心影大多正常。如果經過及時診斷、及時治療，大部分病人可以治癒，個別嚴重病人可能發生死亡。