胺甲蝶呤有抗炎和免疫抑制的作用。服用胺甲蝶呤期間需要補充一些葉酸，通常在使用胺甲蝶呤第二天服用葉酸，這樣可以減少胺甲蝶呤的副作用。
該藥主要是干擾細胞內葉酸的合成，而葉酸是細胞內DNA和RNA合成的原料，當細胞內DNA和RNA合成不足時，細胞的生長就會受到影響。因此胺甲蝶呤可以控制細胞生長，特別是對於那些長得很快的細胞，胺甲蝶呤的作用更為明顯，而對於那些生長基本穩定的細胞作用很小。風濕免疫病的病人體內的免疫系統被異常激活了，體內一些不好的免疫細胞大量增生，引起免疫炎症反應，導致身體器官發炎受損。胺甲蝶呤可以抑制這些異常細胞的生長，減少免疫反應對身體的損傷。正因為胺甲蝶呤對生長基本穩定的細胞作用較小，所以只要把握好劑量，一般不會對身體造成大影響。
胺甲蝶呤分為有片劑和針劑，一般情況下口服片劑就可以，一個禮拜服用一次，使用起來十分方便。部分病人服藥後出現胃腸道不舒服，可以改為使用針劑，減少胃腸道反應。因為胺甲蝶呤會抑制身體葉酸的合成。
胺甲蝶呤是一種臨床常用的抗葉酸類的抗腫瘤藥，在惡性腫瘤的治療中起著十分重要的作用，可以單獨應用，也可以和其他的化療藥物合用。本品常用於治療各型急性白血病，特別是急性淋巴性白血病、惡性淋巴瘤、非何杰金氏淋巴瘤和蕈樣肉芽腫、多發性骨髓病等，也可以用於治療頭頸部癌、肺癌、各種軟組織肉瘤、乳癌、卵巢癌、子宮頸癌、惡性葡萄胎、絨毛膜上皮癌、睪丸癌等。此外，根據國內外指南和專家共識，小劑量的胺甲蝶呤還可以用於治療類風濕性關節炎、多發性肌炎、紅斑性狼瘡等自身免疫性疾病。目前，胺甲蝶呤已被納入國家醫保目錄，進一步降低了病人的用藥負擔。
雖然胺甲蝶呤的治療效果比較理想，但它的副作用還是比較明顯的，許多病人服藥後，會出現胃腸道反應，包括口腔炎、口唇潰瘍、咽喉炎、噁心、嘔吐、腹痛、腹瀉、食慾減退等，偶爾還會出現偽膜性或出血性腸炎等，部分病人會因為嚴重的嘔吐、潰瘍而停藥。此外，有些人還可能出現骨髓抑制，主要包括白血球、血小板減少等。一旦出現任何嚴重不適，請及時就醫。一般在大劑量使用胺甲蝶呤後，需要服用甲醯四氫葉酸鈣，以減輕細胞毒性作用，保護正常細胞組織免受損害。