肝臟有結節除了可能是癌症之外，也有可能是良性病變，具體表現在以下幾個方面。
肝細胞性肝癌是發生於肝臟的常見惡性腫瘤，常見於亞洲和非洲，肝細胞性肝癌多見於50歲左右的成年人，也可見於青年人或兒童，主要表現為腹痛、腹水、黃疸和肝臟腫大。大體上可表現為單個巨塊狀、多髮結節狀或瀰漫累及大部分甚至整個肝臟，肝細胞肝癌一般質軟，常伴有出血、壞死，偶爾可有淤膽而呈綠色。
肝細胞腺瘤在臨床中比較少見，常見於20-40歲的婦女，一般與口服避孕藥有一定關係。70%的肝細胞腺瘤為單發，偶爾有十多個腫瘤，質軟、黃咖啡色，有出血、壞死和纖維化等症狀。
肝硬化是各種原因導致的肝的終末性病變，分為細結節性肝硬化和粗結節性肝硬化。細結節性肝硬化結節直徑一般小於三毫米，顯微間隔很細，結節均勻性說明病變經歷著一致的病理過程，偶爾結節內可見匯管區和肝靜脈。粗結節性肝硬化結節大小不一、多數直徑在三毫米以上，甚至2-3公分，顯微間隔粗細不一，有的呈粗大疤痕，有時因穿刺切片檢查取不到足夠大的範圍而造成診斷困難。
肝結節是影像學檢查後在報告中提出的診斷，可能是肝腫瘤，亦可能是良性病變。因肝結節的診斷通常病變表現不典型，不能確定具體性質，故應對肝結節進行進一步評估，可聯合抽血化驗腫瘤標誌物如甲型胎兒蛋白、糖鏈抗原19-9、糖鏈抗原12-5、癌胚抗原等指標，有助於判斷結節性質。
此外，通過增強檢查如超音波造影、增強CT、增強核磁等，可對結節血供進行進一步評估，根據血供特點，有助於判斷肝結節是良性病變或惡性腫瘤。若常規檢查仍無法確定結節性質，可進行PET-CT掃描，惡性腫瘤對葡萄糖的攝取會顯著增加，而良性病變對葡萄糖的攝取相對較少。若仍鑑別不清，還可做穿刺切片檢查，通過病理檢查，有助於進一步確定結節性質。