毛雪*肉眼所看到的瞳孔區表面有一層組織叫做角膜，角膜是無色、透明。感覺瞳孔上有一個黑點，常見於以下幾種原因：
1. 外界有小蟲子或者異物飛進眼部而停留到角膜上，所以肉眼上看上去有一個黑點，此時可以自行在家用生理鹽水沖洗結膜囊，將異物衝出。
2. 角膜之前被熱的鐵屑崩過，鐵屑沉積在角膜表面，應該立刻前往醫院進行角膜異物剔除，按照醫囑滴用消炎眼藥水，之后角膜上會殘留白色斑翳。
3. 當眼部患有葡萄膜炎時虹膜組織會局部沾黏到角膜上，因為虹膜組織屬於色素組織，沉積角膜上為黑點，應該立刻就醫在醫生指導下進行激素治療。
陶振*眼睛瞳孔裡面有黑點多由玻璃體混濁所致，俗稱飛蚊症，引起飛蚊症的生理性原因和病理性原因，需要根據不同的原因進行不同的處理。
生理性原因
玻璃體退化性變是老人玻璃體進一步液化後，玻璃體外層與視網膜內層分離，形成後玻璃體剝離，因玻璃體膠原增厚並積聚形成玻璃體混濁，病人可以注意到眼前漂浮的物體，如圓點、飛蚊、圓環等，都是濃縮膠體漂浮到視野中時形成的。
病理性原因
高度近視：由於高度近視病人的眼球被拉長和放大，玻璃體也被拉長，當被拉長到一定程度時，玻璃體中的纖維容易斷裂，導致玻璃體混濁，眼前便會出現飛蚊、黑點。
葡萄膜炎：葡萄膜炎病因繁多，發病機制複雜，感染、自身免疫性疾病、炎症性疾病以及各種理化和機械損傷因素等均可引起該病。炎症產生的炎性滲出液、炎性細胞進入玻璃體，均可出現玻璃體渾濁，出現以下症狀：眼睛發紅、眼痛、視物模糊、視力減退、視野中心暗點、眼前有黑影、怕光流淚等。
馮嬋*瞳孔有小黑點，可能是色素痣、飛蚊症以及白內障等原因導致的。
色素沉澱：可能是經常在戶外，眼球暴露在外界，受到日光等照射眼部，使色素沉澱在瞳孔部位，從而會出現該現象，無特殊症狀。
飛蚊症：多發於高度近視的人群，眼球的玻璃體代謝緩慢，使其逐漸沉著，進而與視網膜產生反應，出現該情況，並伴有黑影、眼澀等症狀，可通過雷射進行治療。
白內障：隨著年紀的增大，眼球的組織會不斷退化，眼睛內部的血液受阻，造成局部晶狀體代謝失調，從而導致眼內發生變性反應，誘發白內障。白內障初期會出現瞳孔有小黑點、視力下降等症狀，可通過苄達離胺酸滴眼液、氨碘肽滴眼液來緩解。
瞳孔有黑點出現的原因可能是由於角膜異物導致，例如鐵屑、沙子等如果進入眼睛嵌頓在角膜上，就會導致黑眼球上有黑點，同時還會出現強烈的眼部刺痛、異物感、流淚、怕光、眼紅等症狀，需需要及時將異物取出來。
還可能是由於虹膜色素痣造成，虹膜本身富含色素，局部虹膜細胞如果出現色素代謝異常就會出現黑斑，如果病情穩定通常是不需要進行治療的。
也可能是由於虹膜角膜內皮症候群造成，病人虹膜會出現萎縮從而形成孔洞，形成黑色的斑塊狀外觀，同時還可能會出現繼發性青光眼、角膜內皮功能失代償等併發症。