肝膿瘍的症狀表現有高燒及乏力，還會伴有腹部疼痛和肝區疼痛，也可能會引起黃疸。
細菌性的肝膿瘍通常會表現為高燒的症狀，體溫通常都會達到38.5度以上，而且還會伴有不規則的發燒，在發燒的過程中會有寒戰等症狀，在及時退燒之後還會伴有出汗。
大部分的人群都會出現右上腹部疼痛，而且這種疼痛感呈現為持續性的鈍痛，也可能會放射到右肩部位。右上腹部在做查體檢查的時候也會伴有疼痛感，通常表現為按壓痛和叩擊痛。
肝膿瘍會導致病人出現噁心和嘔吐的症狀，還會伴有四肢乏力和精神倦怠，嚴重者可能有呼吸困難，也有一小部分病人會引起黃疸，通常表現為皮膚發黃或小便黃染，還會伴有鞏膜發黃等症狀，如果沒有及時採取針對性的治療措施，導致病情加重之後，還會引起感染中毒性休克，也會威脅到病人的生命。
肝膿瘍最常見的表現是發熱、寒戰、右上腹痛、食欲不振、食慾減退，部分病人會出現全身乏力、酸疼等。肝膿瘍在臨床中並不少見，大部分原因是繼發於腹腔的膽道逆行感染導致肝膿瘍發生。結石、膽道手術病人容易發生膽道逆流，細菌逆流到肝內，易形成肝膿瘍。
除此之外，糖尿病病人也容易形成肝膿瘍。糖尿病病人形成肝膿瘍後較難控制，因為糖尿病病人容易形成感染，而在肝膿瘍期間血糖也很難控制，雙重因素疊加會導致膿腫感染狀態難以控制。臨床過程中有一些非常複雜的病例，因為患有糖尿病發生膿腫後，甚至會出現感染中毒性休克。所以對於肝膿瘍需要警惕小心，如果發生高熱情況，需要考慮到肝膿瘍的可能性。
肝膿瘍包括細菌性肝膿瘍和阿米巴肝膿瘍，細菌性肝膿瘍往往起病比較急，病人可以突然高燒，39-40℃，伴有畏寒、寒戰以及全身關節肌肉的酸痛，可以出現食慾減退、乏力等。阿米巴肝膿瘍起病相對緩慢，體溫一般都在39℃以下，很少能超過39℃，因為阿米巴肝膿瘍病程比較長，所以病人可以表現為消瘦，夜間可以出現盜汗，這是兩者有差別的地方。
兩者其實也有很多共同點，比如都可以出現類似於肝炎的症狀，比如食慾減退、乏力、噁心、嘔吐、厭油膩，這些消化道的症狀兩者都可以出現。如果膿腫的個頭比較大，如果局限在右肝，兩者都可以出現肝腫大，如果靠近肝包膜，肝臟腫大之後肝包膜受牽拉，都可以引起鈍痛。如果靠近膈肌，壓迫了右肺，也可以引起咳嗽、氣促、呼吸困難，膈肌受刺激，兩者都可以引起右側肩部放射性疼痛。
如果肝臟的膿腫是在左葉，可以出現劍突下的不舒服，有按痛，即壓著可以有壓痛的感覺，兩者都可以出現肝左葉的腫大，在劍突下可以摸到肝臟。左側的膿腫可以有放射到左肩部。膿腫如果個頭比較大，靠近肝包膜也可以破潰，如果破潰，可以引起膈下的膿腫，如果能夠穿過膈肌，還可以引起胸腔的膿腫或者肺膿腫。如果向下破裂，可以引起腹腔膿腫，如果肝左葉的膿腫破潰之後，還可以引起心包膜的炎症以及心包的膿腫。對於膿腫的病人出現了類似的表現，就要考慮是否有肝臟的膿腫發生，要及時的到醫院去就診。