尿道口長透明水泡多見於尿道口囊腫。尿道口或尿道周圍的囊腫在病因上不是很確定，有多種可能的原因，如尿道旁反覆感染所致或生產過程中產道損傷導致等。不同原因造成的尿道口囊腫，預後和最後的變化也不完全一樣。部分由損傷造成的囊腫，隨著組織的修復有可能緩解。
但臨床中絕大多數的尿道口囊腫不會自愈，可能會一直存在或存在波動，即一段時間明顯增大，過段時間又縮小。即使當時觀察變小甚至消失，過一段時間可能又會變大，所以自動消失的可能性相對較小。但是尿道口囊腫不是嚴重疾病，沒有必要過度關注或干預。
尿道口長透明水泡還見於生殖器皰疹，當發生皰疹病毒感染時，可以出現尿道或者龜頭陰莖皮膚的水泡改變，可伴有簇狀分布的水泡，泡液可以自行破裂，破裂以後可以形成局部糜爛，同時可伴有比較明顯疼痛，多為不潔的性接觸而導致的皰疹病毒感染所致，需要進行抗病毒治療。
尿道口出現水泡的現象，可能考慮是局部的感染或者是局部張力性的水泡導致出現的。建議可以觀察看一看水泡有沒有增多、破裂的現象。千萬不要用手去抓撓容易導致出現破裂感染面擴大的現象。
建議可以選擇用黃柏洗液外洗，可以配合用紅黴素軟膏外用試試看，正常的病程需要一週的時間。平時穿過的內褲要用開水燙、在太陽底下暴曬需要穿全棉的內褲。因為尿道口有可能和內褲接觸摩擦導致出現局部感染加重的現象。
在沒有完全治療好之前，最好不要選擇行房，因為容易導致出現局部症狀的加重和交叉感染的現象。而且平時要清淡飲食、不要吃辛辣刺激性的食物和生冷的食物，平時需要多喝白開水增加尿量。
尿道口透明水泡一般是因為包皮過長，或包莖在局部感染因素、局部的刺激下造成黏膜水腫，黏膜水泡形成。此種水泡不但在尿道口比較常見，而且在包皮口、包皮上也有。
所以在出現透明水泡的時候，要看有沒有急尿，比如上衛生間馬上就要去，或者頻尿。比如剛去完衛生間又要去，但是每次排液量很少，或者尿痛，比如尿道有灼燒感、異物感、針扎刀切感。
如果有頻尿、急尿、尿痛，可能有尿路感染的情況，在尿路感染誘發下，引起尿道口的透明水泡。如果存在尿路感染，這時要多喝水、多排尿，讓尿液沖刷局部。
如果尿道口水泡經常出現，也可以考慮將多餘的包皮，即包皮過長或包莖狀態糾正，做包皮環切手術，將局部的刺激誘因去除，不給細菌滋生的機會，可能局部狀況會大大改善。